Dự án trùng tu công trình được thực hiện trong hai năm với kinh phí lên đến hơn 9 tỷ đồng, dự kiến đến tháng 5/2016 sẽ hoàn thành.
Trong hai năm thực hiện dự án, công trình sẽ được tu bổ khu vực tường thành từ Cửa Ngăn đến Cửa Thượng Tứ với chiều dài 269m, cùng với đó là cải tạo mũ tường tại những nơi bị bong tróc vôi vữa, lát gạch Bát Tràng cho đường đi, tu bổ phục hồi kè chắn đất bằng đá hộc và phần tường kè bằng gạch vồ; tu bổ, phục hồi kho đạn...
Trải qua hơn hai thế kỷ với nhiều biến cố của lịch sử, sự tàn phá của chiến tranh, thời tiết khắc nghiệt và nhiều yếu tố khác nên công trình Eo bầu Nam Xương Đài bị xuống cấp nghiêm trọng. Nhiều hạng mục công trình bị các hộ dân lấn chiếm, xây dựng trái phép khiến các kết cấu khối xây bị nứt vỡ, đe dọa đến sự an toàn của công trình và làm mất mỹ quan, gây ô nhiễm và ảnh hưởng trực tiếp đến hình ảnh di tích.
Nhiều hạng mục công trình bị cây cỏ xâm thực, các kết cấu khối xây bị nứt vỡ, đe dọa tới sự an nguy của công trình. Đó là chưa kể đến việc các hộ dân lấn chiếm, xây dựng trái phép, gây mất mỹ quan, làm ô nhiễm và nhiều tác động xấu, ảnh hưởng trực tiếp đến hình ảnh di tích trong khu vực.
Trước đó, dự án tu bổ, tôn tạo hệ thống Kinh thành Huế đã được Ủy ban Nhân dân tỉnh Thừa Thiên-Huế phê duyệt đầu tư tại quyết định số 1918/QĐ-Ủy ban Nhân dân, với tổng mức đầu tư hơn 1.282 tỷ đồng.
Tuy nhiên, với quy mô dự án lớn, số hộ dân bị ảnh hưởng nhiều và còn nhiều vướng mắc khi áp dụng đền bù giữa thực tế và chính sách hiện hành… nên việc giải phóng mặt bằng gặp không ít khó khăn, làm chậm tiến độ triển khai dự án.