Cho đến nay, chưa có tài liệu nào khẳng định Miếu Bà có từ bao giờ. Nhưng theo lưu truyền trong dân gian thì miếu Bà có từ rất lâu đời, khoảng hơn bốn, năm trăm năm trở về trước.
Năm 2003, miếu được trùng tu xây dựng lại trong tổng thể kiến trúc đền miếu với các hạng mục đăng đối, uy nghiêm gồm: điện thờ (chính miếu), ban thờ ngoài trời, hai tòa quan hộ pháp tả vu và hữu vu, phía trước có cặp voi phục chầu và cổng là đôi cột nanh cao lớn hướng ra mặt sông.
Từ đó đến nay, miếu Bà là nơi thờ vọng Loan Nương Thánh Mẫu. Theo sử liệu, Loan Nương Thánh Mẫu chính là bà Nguyễn quý phi, húy Cơ, tự Bích Châu, hiệu Phù Dung, quê ở Hải Hậu, Nam Định, là vợ của vua Trần Duệ Tông. Bà mất ngày 12/2 năm Đinh Tỵ (1377) trên đường hộ giá nhà vua dẫn quân đi đánh Chiêm Thành. Tương truyền mộ phần của bà táng ở cửa biển Kỳ La, Kỳ Hoa.
Sáng ngày 04/2/2025 (7/giêng/ năm Ất Tỵ), Nhân dân trong vùng đã tổ chức lễ khai hạ Miếu Bà với nghi thức cúng, tế, cầu cho mưa thuận gió hòa, cầu cho quốc thái dân an, nhà nhà được bình an... Đây là nét đẹp văn hóa truyền thống được Nhân dân gìn giữ trong thời gian qua, góp phần bảo tồn nét truyền thống văn hóa tâm linh của địa phương.
