Mặc dù còn nhiều khó khăn nhưng tập thể cán bộ giáo viên, nhân viên của Trường THCS Yên Ninh đã nỗ lực không ngừng và đạt được nhiều thành tích nổi bật. Đội ngũ cán bộ, giáo viên đã tích cực tìm tòi, xây dựng các giải pháp đổi mới nâng cao hiệu quả công tác quản lí và dạy học; thực hiện có hiệu quả Chương trình giáo dục phổ thông 2018. Chủ động, linh hoạt thực hiện kế hoạch giáo dục bảo đảm hoàn thành chương trình năm học. Trường tích cực triển khai xây dựng “Trường học hạnh phúc” bằng các hoạt động cụ thể, thiết thực; thực hiện tốt văn hóa học đường và quy tắc ứng xử trong trường học.
Trường được đầu tư, thiết bị, phương tiện dạy học hiện đại như phòng học thông dụng; các phòng thực hành bộ môn Hóa học, Sinh học, phòng ngoại ngữ; được cung cấp bộ thiết bị dạy học tối thiểu cho khối 6,7… đáp ứng yêu cầu cơ bản về thiết bị dạy học phục vụ công tác đổi mới giáo dục và thực hiện chương trình giáo dục phổ thông mới.
Chất lượng dạy và học của Trường THCS Yên Ninh ngày càng được nâng lên. Kết quả thi học sinh giỏi (các môn văn hoá) cấp thành phố, cấp tỉnh và học sinh lớp 9 trúng tuyển vào trường THPT Chuyên Nguyễn Tất Thành hằng năm đều tăng, tạo được lòng tin cho các bậc phụ huynh, xứng đáng là lá cờ đầu trong sự nghiệp giáo dục của thành phố Yên Bái.
